Степан Денисов
и.о. младшего научного сотрудника

Главная Сотрудники Публикации Семинары  и  Конференции Обучение Призы  и  Премии Контакты Англ


Образование и опыт работы:

• 2011 – н.в. инженер-исследователь ИППИ РАН
• 2006 – 2009. Аспирантура факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ
• 2005 – 2006. Дипломная работа “Поиск участков, ответственных за взаимодействия белков GAF(GAGA factor) и Mod(Modifier of mdg4) Drosophila melanogaster с помощью дрожжевой двугибридной системы” (ИБГ РАН)
• 2001 – 2006. Биологический факультет МГУ (кафедра вирусологии)
• 1999 – 2001. СУНЦ МГУ – Школа им. А.Н. Колмогорова

Патенты:

• С.В. Денисов, А.В. Фаворов, А.А. Миронов, М.С. Гельфанд (2011) Программа реконструкции предковых последовательностей методом наибольшего правдоподобия (PredAnSeq). Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2012610080


Публикации:

Denisov S.V., Bazykin G.A., Sutormin R., Favorov A.V., Mironov A.A., Gelfand M.S. and Kondrashov A.S. Weak Negative and Positive Selection and the Drift Load at Splice Sites. Genome Biol Evol. 2014 May 14;6(6):1437-47. PubMed  PDF

Bonchuk A., Denisov S., Georgiev P., Maksimenko O. Drosophila BTB/POZ domains of "ttk group" can form multimers and selectively interact with each other. J Mol Biol. 2011 412(3): 423-436. PubMed  PDF

Denisov S, Gelfand M.S. [Conservedness of the alternative splicing signal UGCAUG in the human and mouse genomes]. Biophysics (Moscow). Russian. 2003 48(1): 30-35


Конференции:

Russian-Germany Seminar«Regulation and Evolution of Cellular Systems” Moscow, Russia, 20-23.06.2012
• S. Denisov. Positive and negative selection in splice sites (poster)

• С.В. Денисов, Г.А. Базыкин. Роль неконсенсусных нуклеотидов в эволюции сайтов сплайсинга: данные по однонуклеотидным полиморфизмам (SNP) и дивергенции. Информационные технологии и системы (ИТиС'12), 19 - 25 августа, 2012, Петрозаводск, Россия
• S.V. Denisov, G.A. Bazykin, A.V. Favorov, A.A. Mironov, M.S. Gelfand. Positive and negative selection in splice sites. Society for Molecular Biology & Evolution Conference 2012 (SMBE 2012), June 23-26, 2012, Dublin, Ireland
• С.В. Денисов. Отбор, действующий на сайты сплайсинга в геномах рода Drosophila. Информационные технологии и системы (ИТиС'11), 2 - 7 октября, 2011, Геленджик, Россия
• S. Denisov. How selection acts on mammalian splice sites. Swiss-Russian seminar "Comparative genomics and transcriptome diversity", February 3-6, 2010, Leysin, Switzerland
• С. Денисов, А. Фаворов, А. Миронов, Р. Нуртдинов, М. Гельфанд. Эволюция сайтов сплайсинга: изменения в отдельных позициях и в сайтах в целом. Информационные технологии и системы (ИТиС'09), 14 - 18 декабря, 2009, пос. д/о Бекасово, Россия
• S. Denisov, A. Gaydukova, A. Mironov, A. Favorov, R. Nurtdinov, M. Gelfand. Evolution of sequences under strong selection: splice sites and Shine-Dalgarno boxes. 4-th International Moscow Conference on Computational Biology (MCCMB'09) July 20-23, 2009, Moscow, Russia
• С. Денисов, А. Миронов, М. Гельфанд. Эволюция под отбором: исследование паттерна замен в сайтах сплайсинга. Информационные технологии и системы (ИТиС'08), 29 сентября - 3 октября, 2008, Геленджик, Россия
• S. Denisov, R. Nurtdinov, P. Mazin, A. Kazakov, G. Kovaleva, M. Gelfand. RASDB – Regulation of Alternative Splicing Database. The Sixth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008) , June 22-28, 2008, Novosibirsk, Russia
• D. Klimov, S. Denisov, M. Skoblov, B. Osmanov, S. Borinskaya, A. Mironov, N.Yankovsky. SNP density biased regions in human genome: distribution and content analysis. The 7th International Meeting on Single Nucleotide Polymorphism and Complex Genome Analysis (SNP'2005) September 22-24, 2005, Leicester, UK
• S. Denisov , M. Gelfand. Conservation of the alternative splicing signal UGCAUG in the human and mouse genomes. The Fourth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2004) July 25-30, 2004, Novosibirsk, Russia