Awards

Home People Publications Seminars  and  Conferences Training Awards Contact


E.E. Khrameeva. Chinese Academy of Sciences, 2011-2012. Fellowship for young international scientists

G.V. Ponomarev, M.S. Gelfand, M.D. Kazanov. First prize at Fetal Femur Challenge: Biometric Measurements from Fetal Ultrasound Images, IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Barcelona, Spain, 2-5.5.2012

Р. Солдатов. Победитель конкурса на 54-й научной конференции МФТИ, ноябрь 2011

М.С. Гельфанд. Премия «Просветитель» 2011 г., специальный диплом Клуба научных журналистов за книгу «Лаборатория Красного Яра» (автор главы глава «У «науки неудачников» все хорошо»)

М.С. Гельфанд. Один из 10 самых авторитетных ученых России 2011 года по версии журнала «Русский репортер»

E.E. Khrameeva. Dynasty Foundation, 2010-2011. Young scientist fellowship (molecular and cellular biology)

С. Петрова. XVII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов", 2010, диплом за лучший доклад

М.С. Гельфанд. 2010. член Европейской академии

М.С. Гельфанд. Один из 10 самых авторитетных ученых России 2010 года по версии журнала «Русский репортер»

XVII Международная научная конференция "Ломоносов-2010", Москва, 14-15.04.2010
• S. Petrova. Comparative analysis of 5’-UTR mRNA structures involved in translational regulation of ribosomal proteins in Proteobacteria and Firmicutes (диплом за лучший доклад)
• Р. Шахбатян. Возрастные особенности экспрессии генов малых некодирующих РНК в мозге человека (диплом за лучший постер)

М.С.Гельфанд, Елена Клещенко. Что может биоинформатика. "Химия и жизнь" №9, 2009. статья Премия РФФИ за лучшую научно-популярную статью 2009 года.

Д. Ракитин. Диплом за лучший доклад. XVI Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2009", Москва, апрель 2009

Е. Храмеева. Премия им. академика А.Е. Северина первой степени (МГУ, 2008)

RusNanoTech. Международный форум по нанотехнологиям, Москва 3-5 декабря 2008
• В.Сорокин. Метагеномный анализ CRISPR-систем прокариотического иммунитета (диплом)
• Е.Храмеева. Вторичные структура РНК, регулирующие сплайсинг (2 премия)

И. Артамонова. стипендия L’Oreal-UNESCO "Для женщин в науке" (2008)

В. Сорокин. Диплом за лучший доклад. XV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2008" (Москва, апрель 2008)

Е. Храмеева. Диплом за лучший доклад. XV Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2008" (Москва, апрель 2008)

Фонд содействия отечественной науке, конкурс 2008 г., победители в номинации "Кандидаты и доктора наук РАН", биологические науки, кандидаты наук: Г.А. Базыкин, К.Ю. Попадьин

Р.Н. Нуртдинов. Премия XIV конкурса Европейской Академии для молодых ученых России по разделу "Биология" (октябрь 2007)

Г.А. Базыкин. Премия за лучший доклад. Информационные технологии и системы ИТиС’07 (Звенигород, сентябрь 2007).

Г.Ю. Ковалева. Премия за лучший доклад. Информационные технологии и системы ИТиС’07 (Звенигород, сентябрь 2007).

Gelfand MS, Mironov AA. 2007. A.A.Baev Prize in Genomics and Genoinformatics (Russian Academy of Sciences) "for work in computer comparative genomics"

Инна Перцовская. Диплом за лучший доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2007" (Москва, апрель 2007)

Artamonova II, Frishman G, Gelfand MS, Frishman D. Association Rule Mining and Protein Databases: Exceptions Point to Annotation Errors (poster). Proceedings of 5th European Conference on Computational Biology ECCB’2006 (Eilat, Israel January 2007)"Top 5 Posters" prize

М.С. Гельфанд, В.А. Любецкий, А.А. Миронов, Д.А. Равчеев Премия за лучшую публикацию в российских научных журналах в 2003-2005 гг за цикл работ под общим названием "Сравнительная геномика" в журнале "Молекулярная биология" (МАИК "Наука", декабрь 2006)

АВ. Любецкая. Диплом за лучший доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2006" (Москва, апрель 2006)

ОН. Коборова. Диплом за лучший стендовый доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2006" (Москва, апрель 2006)

Ф.Н. Еникеева. Премия "Лучшие кандидаты наук РАН" (математические науки) от Фонда поддержки отечественной науки (2006)

А.Г. Витрещак. Премия "Лучшие кандидаты наук РАН" (биология) от Фонда поддержки отечественной науки (2006)

Д. Первушин (докторант ФББ МГУ). Грант INTAS для молодых исследователей (2006-2007)

Д.А. Равчеев (аспирант ФББ МГУ, м.н.с. ИППИ РАН). Стипендия Правительства Российской Федерации на 2005/2006 гг.

О.В. Калинина (аспирант ФББ МГУ). Стипендия Правительства Российской Федерации на 2005/2006 гг.

А.В. Герасимова (аспирант ГосНИИГенетика). Победа в конкурсе "Гранты Москвы - 2005". ISSEP (Международная Соросовская программа образования в области точных наук).

О.В. Калинина (аспирант ФББ МГУ). Победа в конкурсе "Гранты Москвы - 2005". ISSEP (Международная Соросовская программа образования в области точных наук).

Р.Н. Нуртдинов (аспирант ФББ МГУ). Победа в конкурсе "Гранты Москвы - 2005". ISSEP (Международная Соросовская программа образования в области точных наук).

Д.А. Равчеев (аспирант ФББ МГУ, м.н.с. ИППИ РАН). Победа в конкурсе "Гранты Москвы - 2005". ISSEP (Международная Соросовская программа образования в области точных наук).

Е.Д. Ставровская (аспирант ИППИ РАН). Победа в конкурсе "Гранты Москвы - 2005". ISSEP (Международная Соросовская программа образования в области точных наук).

Л.В. Сычева. Диплом за лучший доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2005" (Москва, апрель 2005).

Е.О. Ермакова. Диплом за лучший стендовый доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2005" (Москва, апрель 2005).

Е.Д. Ставровская. Премия "Лучшие аспиранты РАН" (технические науки) от Фонда поддержки отечественной науки (2005)

О.В. Калинина (аспирант ФББ МГУ). Грант INTAS для молодых исследователей (2005-2006)

М. Цыганова и С. Гарушянц. Диплом за лучший доклад. Студенческая конференция Факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ (ноябрь 2004).

О. Коборова. Диплом за лучший стендовый доклад. Студенческая конференция Факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ (ноябрь 2004).

О.В. Калинина. Премия за лучший доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2004" (Москва, апрель 2004)

Д.А. Равчеев и А.В.Герасимова. Диплом за лучший доклад. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов-2004" (Москва, апрель 2004)

М.С. Гельфанд. Премия "Лучшие доктора наук РАН" (биология) от Фонда поддержки отечественной науки (2004-2005).

М.С. Гельфанд, А.А. Миронов и соавторы  "Лучшая работа ПИЯФ"  2002 г.


Rodionov DA, Gelfand MS, Todd JD, Curson A.R.J, Johnston A.W.B. Computational Reconstruction of Iron- and Manganese-Responsive Transcriptional Networks in alfa-Proteobacteria. PLoS Comput Biol. 2006, 444:240. PubMed  PDF

Faculty of 1000 Evaluation

Sorci L, Martynowski D, Rodionov D.A, Eyobo Y, Zogaj X, Klose K.E, Nikolaev E.V, Magni G, Zhang H, Osterman A.L.
Nicotinamide mononucleotide synthetase is the key enzyme for an alternative route of NAD biosynthesis in Francisella tularensis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009, 106: 3083-8. PubMed  PDF

D.A. Rodionov, P. Hebbeln, A. Eudes, J. ter Beek, I.A. Rodionova, G.B. Erkens, D.J. Slotboom, M.S. Gelfand, A.L. Osterman, A.D. Hanson, T. Eitinger.
A novel class of modular transporters for vitamins in prokaryotes. J Bacteriol. 2009, 191: 42-51. PubMed  PDF

V. Sorokin, K. Severinov, M.S. Gelfand.
Systematic prediction of control proteins and their DNA binding sites. Nucleic Acids Res. 2009, 37: 441-51. PubMed  PDF

Popadin K, Polishchuk LV, Mamirova L, Knorre D, Gunbin K.
Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals. Proc Natl Acad Sci USA. 2007, 104(33):13390-5. PubMed   PDF
   This paper addresses the effectiveness of selection against mildly deleterious mutations in larger versus smaller bodied mammals. Mitochondrial protein-coding genes apparently show relatively higher rates of nonsynonymous substitutions in larger bodied mammals, suggesting weaker purifying selection in larger species. The authors suggest that this is due to lower effective population sizes characteristic of large bodied species. Potentially this is another factor leading to the higher rates of decline and extinction in larger compared to smaller mammal species.
(Georgina Mace, Imperial College, United Kingdom)

Rodionov DA, Dubchak IL, Arkin AP, Alm EJ, Gelfand MS.
Dissimilatory metabolism of nitrogen oxides in bacteria: comparative reconstruction of transcriptional networks.
PLoS Comput Biol. 2005, 1(5):e55. PubMed  PDF
   The power of comparative genomics is nicely illustrated in this paper, in which the authors predict the regulons that respond to nitrogen oxides and oxyanions in a large number of bacterial genomes. While structural and regulatory genes are quite well conserved, there is considerable flexibility in the organisation of regulatory networks. There's lots here to stimulate experimentalists.
(Stephen Spiro, Georgia Institute of Technology, United States of America)

Kotelnikova EA, Makeev VYu, Gelfand MS.
Evolution of transcription factor DNA binding sites.
Gene. 2005, 347 (2): 255-263. PubMed  PDF
   This article confirms that the consensus motif identified by many transcription-binding site databases (particularly as represented by the most frequently used Position Weight Matrices) tend to ignore functionally important binding sites, in part, because they do not include nucleotides that the authors here show to be evolutionarily conserved. Moreover, the authors demonstrate several instances on which specificity and function of a transcription factor is likely to be related to the nucleotides not included in the standard consensus motif but which are indeed evolutionarily conserved.
(Isaac Kohane Harvard Medical School, Children's Hospital, United States of America)

Panina EM, Mironov AA, Gelfand MS.
Comparative genomics of bacterial zinc regulons: enhanced ion transport, pathogenesis, and rearrangement of ribosomal proteins.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2003, 100(17):9912-7.PubMed  PDF
   Zinc uptake systems in bacteria are frequently regulated by zinc-sensing repressor proteins of the Zur family. In this paper, the authors propose a mechanism whereby bacteria maintain zinc availability for essential enzymes. The authors use a pure bioinformatics approach to define consensus sequences for Zur-like regulators and thereby identify candidate target genes for zinc-dependent regulation. The authors correctly predict that some bacteria may, under conditions of limited zinc, replace zinc-containing ribosomal proteins with non-zinc containing paralogs: a phenomenon recently documented in Bacillus subtilis by Fujio Kawamura and coworkers (unpublished communication).
(John Helmann, Cornell University, United States of America)


Highly accessed

Zhang Y, Rodionov D.A, Gelfand M.S, Gladyshev V.N.
Comparative genomic analyses of nickel, cobalt and vitamin B12 utilization. BMC Genomics. 2009, 10: 78. PubMed  PDF

Nurtdinov RN, Neverov AD, Favorov AV, Mironov AA, Gelfand MS.
Conserved and species-specific alternative splicing in mammalian genomes. BMC Evol Biol. 2007, 7(1):249. PubMed  PDF

Bazykin GA, Kondrashov FA, Brudno M, Poliakov A, Dubchak I, Kondrashov AS.
Extensive parallelism in protein evolution. Biol Direct. 2007, 2:20. PubMed  PDF

Mamirova L, Popadin K, Gelfand MS.
Purifying selection in mitochondria, free-living and obligate intracellular proteobacteria. BMC Evol Biol. 2007, 7(1):17. PubMed  PDF

Ermakova EO, Nurtdinov RN, Gelfand MS.
Fast rate of evolution in alternatively spliced coding regions of mammalian genes. BMC Genomics. 2006, 7(1):84 PubMed  PDF

Neverov AD, Artamonova II, Nurtdinov RN, Frishman D, Gelfand MS, Mironov AA.
Alternative splicing and protein function. BMC Bioinformatics. 2005, 6(1):266 PubMed  PDF

Featured articles

Novichkov P.S, Laikova O.N, Novichkova E.S, Gelfand M.S, Arkin A.P, Dubchak I, Rodionov D.A. RegPrecise: a database of curated genomic inferences of transcriptional regulatory interactions in prokaryotes. Nucleic Acids Res. 2010, PubMed  PDF

Novichkov P.S, Rodionov D.A, Stavrovskaya E.D, Novichkova E.S, Kazakov A.E, Gelfand M.S, Arkin A.P, Mironov A.A, Dubchak I. RegPredict: an integrated system for regulon inference in prokaryotes by comparative genomics approach. Nucleic Acids Res. PubMed  PDF