• В. Закирзянова (2 курс)
  Исследование обобщенного FruR (Cra)-регулона гамма-протеобактерий методами сравнительной геномики
  Руководитель Д.А. Равчеев, ст. рук. М.С. Гельфанд

• А.В. Любецкая (2 курс)
  Потоковая модель метаболизма аминокислот кишечной палочки
  Руководитель М.С. Гельфанд
  (диплом за лучший доклад на конференции "Ломоносов-2005")

• А. Ким (2 курс)
  Есть ли особенности в аминокислотных последовательностях транспортеров из термофильных бактерий?
  (предварительное название)
  Руководитель О.В. Калинина, ст. рук. А.Б. Рахманинова

• А. Кривошей (2 курс).
  Исследование специфичности мембранных транспортеров семейства DAACS
  Руководитель О.В. Калинина, ст. рук. А.Б. Рахманинова

• Ю. Коростелев (2 курс)
  Моделирование взаимодействия RbsR_Ecoli с его оператором (предварительное название)
  Руководители А.Б. Рахманинова и А.В. Головин

• Д.А. Решетов (2 курс).
  Исследование специфичности мембранных транспортеров семейства DAACS
  Руководитель О.В. Калинина, ст. рук. А.Б. Рахманинова

• И. Антонов (3 курс)
  Алгоритм множественного выравнивания с использованием якорей (предварительное название)
  Руководитель А.А. Миронов

• Я. Вольдгорн (3 курс)
  Эволюция белков семейства MAGEA
  Руководитель Артамонова И.И., ст. рук. М.С. Гельфанд

• С. Еремеев (3 курс)
  Регулон NifA+RpoN альфа-протеобактерий (предварительное название)
  Руководитель Д.А. Родионов, ст. рук. М.С. Гельфанд

• О. Коборова (3 курс)
  Разработка новой версии программы распознавания SDP и классификации белков (предварительное название)
  Руководитель О.В. Калинина, ст. рук. А.Б. Рахманинова
  (диплом за лучший стендовый доклад на студенческой конференции)

• М. Цыганова (3 курс)
  Регуляция дыхания энтеробактерий: сопоставление данных по анализу экспрессии на биочипах и сравнительного-геномного анализа.
  Руководитель Д.А. Равчеев, ст. рук. М.С. Гельфанд

• А. Литвинова (4 курс)
  Изучение расположения альтернативных сайтов сплайсинга
  Руководитель А.А. Миронов

• И. Перцовская и А. Никулова (4 курс)
  Исследование кластеризации сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме человека
  Руководитель А.А. Миронов

• Л. Сычева (4 курс)
  Таксон-специфическая регуляция SOS-ответа у гамма-протеобактерий
  Руководитель Е.А. Пермина, ст. рук. М.С. Гельфанд

• К. Фоминых (4 курс)
  Исследование регуляции азотофиксации в бактериях порядка Rhizobiales методами сравнительной геномики
  Руководитель Д.А. Равчеев, ст. рук. М.С. Гельфанд