Лейн Семен Александрович
аспирант

Главная Сотрудники Публикации Семинары  и  Конференции Обучение Призы  и  Премии Контакты Англ


Научные интересы:

- реконструкция регуляторных сетей и метаболических путей в бактериях
- поиск сайтов посадки транскрибционных факторов в бактериальных геномах с использованием сравнительной геномики
- эволюция регуляции транскрибции у бактерий

Образование:

2009 – н.в: аспирант Института Проблем Передачи Информации им. А.А.Харкевича
2003 – 2009: Российский Химико-Технологичский Университет им. Д.И.Менделеева, магистр

Исследовательский опыт:

2009 – н.в: Институт Проблем Передачи Информации РАН
2010-05 – 2010-06: Lawrence Berkeley National Laboratory (Беркли, США)
2006 – 2009: Институт Биохимии им. А.Н.Баха


Публикации:


Novichkov PS, Kazakov AE, Ravcheev DA, Leyn SA, Kovaleva GY, Sutormin RA, Kazanov MD, Riehl W, Arkin AP, Dubchak I, Rodionov DA. RegPrecise 3.0 -- A resource for genome-scale exploration of transcriptional regulation in bacteria. BMC Genomics. 2013 Nov 1;14(1):745. PubMed  PDF

Sun EI, Leyn SA, Kazanov MD, Saier MH Jr, Novichkov PS, Rodionov DA. Comparative genomics of metabolic capacities of regulons controlled by cis-regulatory RNA motifs in bacteria. BMC Genomics. 2013 Sep 2;14:597.PubMed  PDF

Leyn S.A., Kazanov M.D., Sernova N.V., Ermakova E.O., Novichkov P.S., Rodionov D.A. Genomic Reconstruction of the Transcriptional Regulatory Network in Bacillus subtilis. J Bacteriol 2013 195(11): 2463-2473. PubMed  PDF

Ravcheev D.A., Li X., Latif H., Zengler K., Leyn S.A., Korostelev Y.D., Kazakov A.E., Novichkov P.S., Osterman A.L., Rodionov D.A. Transcriptional regulation of central carbon and energy metabolism in bacteria by redox-responsive repressor Rex. J Bacteriol 2012 194(5): 1145-1157. PubMed  PDF

Leyn S.A., Li X., Zheng Q., Novichkov P.S., Reed S., Romine M.F., Fredrickson J.K., Yang C., Osterman A.L., Rodionov D.A. Control of proteobacterial central carbon metabolism by the HexR transcriptional regulator: a case study in Shewanella oneidensis. J Biol Chem 2011 286(41): 35782-35794. PubMed  PDF

Конференции:
The 5th International Moscow Conference on Computational Molecular Biology, MCCMB-2011. Moscow. Russia, 21-14.07.2011
• S.Leyn, M.Kazanov, P.Novichkov, D.Rodionov Reference collection of transcriptional regulons in Bacillales family of bacteria (poster)

The 110th General Meeting of the American Society for Microbiology
• D.A. Rodionov, X. Li, A. Osterman, S. Leyn. Comparative and Functional Genomics of the Central Carbon Metabolism Regulon HexR in Proteobacteria.

Информационные технологии и системы ИТиС’09, Бекасово, 15-18.12.2009
• С.А. Лейн, Д.А. Равчеев. Эволюция химерного белка: исследование AraR-зависимой регуляции методами сравнительной геномики