• Международное сотрудничество
- Nels Larsen (University of British Columbia, Vancouver, Canada)
"Conservation of co-expression graph in bacteria". Supervisor: M.S. Gelfand

• Дипломные работы
- Е. Литвинова
Метагеномы как объединение геномов штаммов: особенности эволюции генов из различных функциональных групп
рук. АБ. Рахманинова, консультант МС. Гельфанд
- А. Никулова
Сравнительный анализ кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов в геномах млекопитающих
рук. АА. Миронов
- И. Перцовская
Сравнительный анализ CpG островов в геномах млекопитающих
рук. АА. Миронов
- Д. Пилипенко
Разработка системы хранения и аннотирования геномов
рук. АА. Миронов
- Л. Сычева
Функциональная аннотация метагенома бактерий кишечника человека
рук. МС. Гельфанд

• Курсовые работы:
- А. Голанд (мех-мат)
Эвристические и полуэвристические алгоритмы восстановления предковых последовательностей
рук. О. Калинина, ст.рук. АА. Миронов
- П.В. Мазин (4курс)
Предсказание специфичности в семействе ОРА PDF
SDPlight - быстрый метод поиска позиций, определяющих специфичность в белковых выравниваниях
рук. О.В.Калинина, ст.рук. А.Б.Рахманинова
- А. Зинин
Применение Скрытых Марковских Моделей для поиска кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов
рук. АА. Миронов
- А. Ким (3 курс)
Поиск генов регуляторных РНК в геномах бактерий
рук. А. Герасимова, Е.Ставровская, ст.рук. МС. Гельфанд
- Ю. Коростелев (3 курс)
Позиционно-специфические корреляции между аминокислотными последовательностями ДНК-связывающих доменов LACI-семейства и нуклеотидными последовательностями их операторов
рук. А.Б. Рахманинова
- О. Цой
Исследование RbsR- и PurR-регулонов методами сравнительной геномики
рук. Д.А. Равчеев, ст. рук. М.С. Гельфанд
- М. Юрьева
Исследование фосфатного регулона грам-положительных бактерий методами сравнительной геномики
рук. Д.А. Равчеев, ст.рук. МС. Гельфанд
- Моросанова М.А. (2 курс)
Предсказание позиций, определяющих функциональную специфичность в белках бактериальных двухкомпонентных систем
рук. О.В.Калинина, ст.рук. А.Б.Рахманинова
- В. Закирзянова
Исследование эволюции комплементарных рамок считывания генов глютаматдегидрогеназы gdh и шаперона dnaK
рук. Д.А. Равчеев, ст.рук. МС. Гельфанд
- А. Любецкая (3 курс)
Анализ графа соавторства и ключевых слов в статьях по биоинформатике
рук. МС. Гельфанд